Непокрытая часть расходов является дефицитом бюджета, который мог возникнуть в связи с неэффективным планированием деятельности ННО, чрезвычайными обстоятельствами или по другим причинам.

Возникший дефицит разумно представлять в пассиве баланса (строки 300-302 раздела IV "Финансовые результаты" Баланса (форма N 1). А так как счета учета целевых поступлений не могут иметь отрицательный (минусовой) остаток, имеет смысл отражать его в качестве полученного убытка от уставной деятельности ННО на отдельном субсчете 8700 "Нераспределенная прибыль (непокрытый убыток)", который в последующем будет закрыт путем получения дополнительного финансирования.